【導(dǎo)讀】如果我們能夠?qū)⑽锢韺W(xué)和生物學(xué)相結(jié)合,在硅芯片表面迅速研發(fā)出經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的新型個(gè)體化藥物,用于治療癌癥、代謝紊亂和傳染病,那會(huì)怎么樣?現(xiàn)在想象一下,如果這種突破性技術(shù)能夠利用大自然的力量,并為人類(lèi)提供應(yīng)對(duì)醫(yī)藥、制造業(yè)和農(nóng)業(yè)領(lǐng)域最關(guān)鍵挑戰(zhàn)的途徑,又會(huì)怎么樣?
合成生物學(xué)并非科幻小說(shuō)中遙不可及的幻想,而是一項(xiàng)革命性的跨學(xué)科新技術(shù),旨在使生物學(xué)技術(shù)輕松實(shí)現(xiàn)工程設(shè)計(jì)。這項(xiàng)技術(shù)融合了化學(xué)、生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和工程學(xué)的各種先進(jìn)技術(shù),用于設(shè)計(jì)和制造自然界中不存在的生物組分、解決方案和系統(tǒng)。可以將合成生物學(xué)看作是一個(gè)基于生物學(xué)的工具包,它使用抽象、標(biāo)準(zhǔn)化和自動(dòng)化構(gòu)造來(lái)改變我們構(gòu)建生物系統(tǒng)的方式,并擴(kuò)展可行產(chǎn)品的范圍1。
Evonetix一直在重新定義生物學(xué)和開(kāi)發(fā)一種以前所未有的精度和規(guī)模合成長(zhǎng)鏈DNA的截然不同的解決方案。這家生物技術(shù)初創(chuàng)公司的使命是促進(jìn)合成生物學(xué)領(lǐng)域的快速發(fā)展,提高開(kāi)發(fā)合成生物解決方案(如可以挽救生命的疫苗)的質(zhì)量和速度并降低其成本,從而改善全球人口健康。
為了快速開(kāi)發(fā)先進(jìn)平臺(tái)并將其推向市場(chǎng),Evonetix需要一個(gè)具有深厚領(lǐng)域知識(shí)、生物
傳感器解決方案、MEMS處理和半導(dǎo)體精密加工專(zhuān)業(yè)知識(shí)的合作伙伴。Evonetix選擇攜手ADI公司及其創(chuàng)新中心Analog Garage,助力實(shí)現(xiàn)愿景,并將DNA合成交到全球每一位研究人員的手中。
概覽
公司
Evonetix是一家總部位于英國(guó)劍橋的生物技術(shù)初創(chuàng)公司,是一家開(kāi)發(fā)可擴(kuò)展、高保真和快速基因合成桌面平臺(tái)的合成生物技術(shù)公司。
應(yīng)用
新型可以挽救生命的藥物的發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā),治療分子設(shè)計(jì)和合成,以及精準(zhǔn)醫(yī)療和診斷。
挑戰(zhàn)
快速開(kāi)發(fā)經(jīng)濟(jì)實(shí)惠、即插即用、桌面DNA寫(xiě)入器平臺(tái),擴(kuò)大規(guī)模并實(shí)現(xiàn)商業(yè)化。在2022年初創(chuàng)建最簡(jiǎn)可行產(chǎn)品(MVP)。
目標(biāo)
使世界各地實(shí)驗(yàn)室的科學(xué)家能夠快速合成長(zhǎng)鏈DNA,改善全球人口健康。
傳統(tǒng)DNA合成
30多年來(lái),合成DNA的方法一直是構(gòu)建DNA單鏈,然后將它們組合形成更長(zhǎng)的雙鏈DNA。目前的技術(shù)速度較慢,并包含隨機(jī)錯(cuò)誤,需要花時(shí)間進(jìn)一步分析和排序,才能確保獲得可接受的質(zhì)量。因此,這一過(guò)程阻礙了新藥物療法的快速發(fā)展和醫(yī)療保健的進(jìn)步。
EVONETIX生物合成
Evonetix提出的專(zhuān)有方法是開(kāi)發(fā)一個(gè)將物理學(xué)和生物學(xué)相結(jié)合的平臺(tái),在芯片表面成千上萬(wàn)個(gè)獨(dú)立控制的微型反應(yīng)位點(diǎn)調(diào)節(jié)DNA的合成。
圖1. 硅芯片
圖2. 芯片上的微型反應(yīng)位點(diǎn)
圖3. 長(zhǎng)鏈DNA的合成
圖4. 識(shí)別并清除錯(cuò)誤
合成之后,將通過(guò)一個(gè)突破性工藝過(guò)程識(shí)別并清除錯(cuò)誤,精度將比傳統(tǒng)方法高幾個(gè)數(shù)量級(jí)。合成DNA技術(shù)提供個(gè)性化、個(gè)體化藥物,使醫(yī)療專(zhuān)業(yè)人員能夠做出更合理、更準(zhǔn)確的病人護(hù)理決策。
共同努力實(shí)現(xiàn)宏偉目標(biāo)
ADI在不斷探索生物技術(shù)初創(chuàng)企業(yè)前景的過(guò)程中,與Evonetix合作,研究新技術(shù),構(gòu)建新功能,開(kāi)拓新商機(jī)。ADI的生物傳感器解決方案專(zhuān)業(yè)知識(shí)、先進(jìn)的MEMS處理技術(shù)以及獨(dú)特的半導(dǎo)體精密加工能力是Evonetix實(shí)現(xiàn)其快速生物合成愿景所需的三個(gè)關(guān)鍵要素。這三項(xiàng)技術(shù)有助于加快藥物發(fā)現(xiàn)。
2019年1月,Evonetix開(kāi)始與ADI的內(nèi)部孵化器和創(chuàng)新中心Analog Garage合作。此次合作將加速Evonetix首款桌面DNA寫(xiě)入器的開(kāi)發(fā)和擴(kuò)展,推動(dòng)實(shí)現(xiàn)商業(yè)化。同時(shí)設(shè)定了一個(gè)宏偉目標(biāo):到2022年初完成MVP的開(kāi)發(fā)。
ADI公司數(shù)字醫(yī)療健康高級(jí)副總裁Patrick O’Doherty表示:“通過(guò)與Evonetix合作,ADI公司得以進(jìn)入不斷發(fā)展的合成生物市場(chǎng)”。
“此次合作旨在提高基因組裝的速度和降低其成本,以形成可用于生產(chǎn)經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的藥物并在全球范圍內(nèi)治療各種疾病的創(chuàng)新戰(zhàn)略。”
——Patrick O’Doherty
——ADI公司 | 數(shù)字醫(yī)療健康高級(jí)副總裁
ANALOG GARAGE
Patrick O’Doherty指出:“Analog Garage將世界領(lǐng)先的研究型大學(xué)和高科技初創(chuàng)企業(yè)的工程師、數(shù)據(jù)科學(xué)家、硬件和軟件人員匯集在一起。其中很多人擁有信號(hào)處理、機(jī)器學(xué)習(xí)或材料科學(xué)領(lǐng)域的博士學(xué)位,這些都是典型半導(dǎo)體公司的非傳統(tǒng)技能,他們?cè)诳焖侔l(fā)展的創(chuàng)業(yè)環(huán)境中,積極創(chuàng)建新的解決方案和突破性技術(shù)。”
“Analog Garage研發(fā)團(tuán)隊(duì)利用科學(xué)、算法、數(shù)據(jù)及其創(chuàng)造力提供解決方案,為我們的客戶(hù)解決挑戰(zhàn)性問(wèn)題。我們一直在尋找優(yōu)秀人才和公司,攜手構(gòu)建改變世界的解決方案。”Analog Garage分部總經(jīng)理Pat Coady表示。
圖5
Evonetix與Analog Garage合作,攜手開(kāi)發(fā)集成式解決方案,包括MEMS平臺(tái),這是一種專(zhuān)用集成電路(ASIC),旨在實(shí)現(xiàn)微型控制電子元件和流動(dòng)池。
Evonetix目前正在使用ADI公司的測(cè)試芯片傳感器結(jié)構(gòu)進(jìn)行測(cè)試,在未來(lái)兩年內(nèi),將進(jìn)行更多的實(shí)驗(yàn)、評(píng)估和驗(yàn)證。最終的芯片尚未完全開(kāi)發(fā)完畢。ADI公司將負(fù)責(zé)該技術(shù)的商業(yè)推廣,并幫助生產(chǎn)桌面DNA寫(xiě)入器設(shè)備。ADI公司計(jì)劃在開(kāi)發(fā)階段完成后立即生產(chǎn)該傳感器芯片。
“Analog Garage研發(fā)團(tuán)隊(duì)的支持和專(zhuān)業(yè)技術(shù)在幫助我們?cè)O(shè)計(jì)復(fù)雜控制ASIC方面發(fā)揮了不可估量的作用,我們期待進(jìn)一步展開(kāi)合作,以實(shí)現(xiàn)該平臺(tái)的商業(yè)化規(guī)模生產(chǎn)。”
——Matthew Hayes博士
——Evonetix首席技術(shù)官
Evonetix即插即用桌面設(shè)備
圖6. Evonetix桌面設(shè)備的設(shè)計(jì)概念圖
Evonetix DNA寫(xiě)入器將是一款即插即用桌面儀器,易于獲取和使用。它將通過(guò)一次性專(zhuān)用盒體支持多種功能和應(yīng)用,這些盒體包含大量的復(fù)雜組件并支持高度并行的合成。
Evonetix的首款產(chǎn)品預(yù)計(jì)將在2021年底進(jìn)入beta測(cè)試階段。之后,ADI和Evonetix將繼續(xù)合作,共同提高基因組裝的速度,提高效率和精度,降低成本。
“我們的使命是開(kāi)發(fā)高度并行的桌面平臺(tái),以實(shí)現(xiàn)DNA合成的精度和規(guī)模。與ADI公司的合作使我們向前邁出了重要的一步。”
——Matthew Hayes博士
——Evonetix首席技術(shù)官
對(duì)人類(lèi)的影響
圖7
抗擊疫情
在撰寫(xiě)本文時(shí),還沒(méi)有獲得批準(zhǔn)的COVID-19新冠病毒疫苗或治愈方法。但是世界各地的研究人員都在利用他們所擁有的技術(shù)努力尋找解決方案。人類(lèi)終將擊敗COVID-19新冠病毒,但就目前而言,未來(lái)仍未可知。
Evonetix突破性桌面平臺(tái)的最終開(kāi)發(fā)和商業(yè)化進(jìn)程可能無(wú)法在抗擊COVID-19新冠肺炎疫情的過(guò)程中發(fā)揮重要作用。但是,Evonetix至關(guān)重要的、截然不同的基因合成方法,可能在抗擊下一次及以后的疫情中發(fā)揮重要作用。這項(xiàng)技術(shù)讓未來(lái)充滿(mǎn)了希望,使全世界的研究人員能夠快速、準(zhǔn)確、經(jīng)濟(jì)高效地開(kāi)發(fā)出挽救生命的藥物和疫苗。
對(duì)人類(lèi)的深遠(yuǎn)影響
DNA合成有望助力實(shí)現(xiàn)旨在生產(chǎn)經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的藥物并治療各種疾病的創(chuàng)新戰(zhàn)略。合成生物學(xué)可用于制藥和新藥研發(fā)、先進(jìn)生物燃料、工業(yè)生物技術(shù)、特種化學(xué)品、可再生能源、農(nóng)業(yè)和材料科學(xué)等各種領(lǐng)域的應(yīng)用。它可能有助于減少我們對(duì)石油的依賴(lài),阻止傳染病的傳播,并滿(mǎn)足世界饑餓人口的營(yíng)養(yǎng)需求。
快速而準(zhǔn)確的基因合成加速了科學(xué)家大規(guī)模利用生物學(xué)的能力,這是使用其他方法無(wú)法實(shí)現(xiàn)的。Evonetix和ADI合作開(kāi)發(fā)的這項(xiàng)技術(shù)能夠解決人類(lèi)面臨的最大挑戰(zhàn),為人類(lèi)創(chuàng)造一個(gè)更美好、更安全、更健康的地球生存環(huán)境。
1工程生物學(xué)研究聯(lián)盟。
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